Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT7

CCDC124, Coiled-coil domain-containing protein 124, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC124Q96CT7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms