Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX21Q969T3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms