Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
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PTPRUQ92729 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
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PTPRUQ92729 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
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