Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3RF3Q8TEJ3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3RF3Q8TEJ3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3RF3Q8TEJ3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3RF3Q8TEJ3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3RF3Q8TEJ3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3RF3Q8TEJ3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3RF3Q8TEJ3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3RF3Q8TEJ3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3RF3Q8TEJ3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3RF3Q8TEJ3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF3Q8TEJ3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms