Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms