Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
GCSAMQ8N6F7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms