Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL2Q8N4E4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms