Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms