Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms