Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q71RC1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q71RC1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q71RC1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q71RC1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms