Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms