Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms