Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms