Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms