Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms