Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms