Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CARMIL1Q5VZK9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms