Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOCADQ5VW36 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms