Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms