Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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LINC01545Q5VT33 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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LINC01545Q5VT33 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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LINC01545Q5VT33 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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LINC01545Q5VT33 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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LINC01545Q5VT33 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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LINC01545Q5VT33 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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LINC01545Q5VT33 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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LINC01545Q5VT33 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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LINC01545Q5VT33 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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