Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms