Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITRM1Q5JRX3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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