Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C3orf38Q5JPI3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C3orf38Q5JPI3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms