Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms