Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP27-1Q3LI81 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms