Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms