Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
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COL24A1Q17RW2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
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