Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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RTN1Q16799 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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RTN1Q16799 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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RTN1Q16799 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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RTN1Q16799 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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RTN1Q16799 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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