Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
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