Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ETFDHQ16134 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms