Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms