Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
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