Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms