Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD6Q15008 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms