Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
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