Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPIDRQ14159 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms