Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms