Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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