Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
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SHROOM2Q13796 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
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SHROOM2Q13796 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.38
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SHROOM2Q13796 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
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SHROOM2Q13796 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
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SHROOM2Q13796 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
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SHROOM2Q13796 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
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SHROOM2Q13796 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
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SHROOM2Q13796 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
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SHROOM2Q13796 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
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SHROOM2Q13796 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
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SHROOM2Q13796 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
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SHROOM2Q13796 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
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SHROOM2Q13796 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
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SHROOM2Q13796 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
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