Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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