Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP140Q13342 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP140Q13342 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SP140Q13342 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP140Q13342 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP140Q13342 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP140Q13342 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP140Q13342 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP140Q13342 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP140Q13342 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP140Q13342 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP140Q13342 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP140Q13342 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP140Q13342 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP140Q13342 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP140Q13342 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP140Q13342 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP140Q13342 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP140Q13342 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP140Q13342 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP140Q13342 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP140Q13342 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP140Q13342 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP140Q13342 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP140Q13342 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP140Q13342 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP140Q13342 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP140Q13342 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP140Q13342 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP140Q13342 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP140Q13342 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP140Q13342 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP140Q13342 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP140Q13342 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP140Q13342 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP140Q13342 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP140Q13342 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SP140Q13342 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SP140Q13342 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SP140Q13342 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SP140Q13342 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SP140Q13342 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SP140Q13342 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SP140Q13342 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SP140Q13342 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SP140Q13342 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SP140Q13342 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SP140Q13342 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SP140Q13342 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SP140Q13342 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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