Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SCGB2A2Q13296 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SCGB2A2Q13296 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SCGB2A2Q13296 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SCGB2A2Q13296 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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SCGB2A2Q13296 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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