Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms