Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms