Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC10A2Q12908 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms