Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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GTF3C1Q12789 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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GTF3C1Q12789 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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GTF3C1Q12789 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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GTF3C1Q12789 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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