Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms