Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms