Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SOS1Q07889 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms