Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms